Las raíces aéreas son completamente normales en las Phalaenopsis y ¡no es signo de que la planta esté sufriendo! Tu orquídea simplemente está haciendo lo que haría en la naturaleza, donde estas plantas viven en los árboles y desarrollan raíces que se exponen al aire. Si salen por todos lados es incluso una buena señal de que la humedad es decente y la planta está bien. Déjalas donde están, no sirven de nada si las fuerzas dentro de la maceta y además solo corres el riesgo de estresarla y causarle heridas.
Lo que puedes hacer en cambio es facilitar su función. Las raíces aéreas absorben humedad y oxígeno del aire, así que si nebulizas la planta regularmente u ocasionalmente pasas un paño húmedo por ellas, la planta las utiliza de verdad y crecen más robustas. Un truco que muchos no hacen es envolver las raíces aéreas con musgo vivo húmedo (tipo con una goma elástica alrededor) durante unas cuantas semanas - la planta las usará para absorber agua y nutrientes directamente, y se volverán aún más fuertes. No es obligatorio, eh, ¡es más que nada para que ella esté aún mejor!
La única situación en la que te conviene intervenir es si la maceta es realmente demasiado grande respecto a la planta, porque entonces no logra secarse bien y el riesgo de pudrición aumenta. Pero si el trasplante es reciente y el drenaje es bueno, ¡puedes estar tranquila así!