Não é bem verdade que todos usam só esses dois, mas tá bom, entendo que são os mais populares. Para quadrinhos em particular, Clip Studio Paint é definitivamente a escolha mais óbvia entre os dois. Tem ferramentas pensadas especificamente para quadrinhos: gestão de páginas, balões para diálogos, efeitos mangá, padrões prontos. Procreate é fantástico para ilustração e pintura, mas para quadrinhos de verdade você precisa botar mais trabalho manual. Se seu objetivo é mesmo fazer quadrinhos do zero, não é a ferramenta ideal.
Dito isso, também depende do que você entende por "quadrinhos". Se quer fazer algo mais artístico e pictórico, tipo quadrinhos de alta qualidade ou graphic novels muito ilustradas, Procreate pode ser suficiente sem problemas. Mas se pensa em quadrinhos com páginas estruturadas, vinhetas regulares e textos integrados, então Clip Studio Paint realmente tira um monte de trabalho manual e tedioso. Com ele você desenha o painel, ele cria a grade pra você, os balões você coloca em dois segundos.
A única desvantagem real do Clip é o preço de compra mais alto comparado ao Procreate, mas considerando quanto você economiza em tempo e frustração quando trabalha com quadrinhos de verdade, eu diria que vale a pena. Testa à vontade a versão trial dos dois antes de decidir, mas se a velocidade de produção importa, Clip vence de lavada para quadrinhos.