O maior erro é achar que uma plataforma única vai resolver tudo - você precisa combinar fontes, não ficar alternando entre elas toda semana. Khan Academy é sólido pra entender conceitos, mas o ENEM cobra mais interpretação e contexto, então complementa com questões de provas antigas (que é de graça em qualquer lugar) e vê vídeos específicos sobre pegadinhas do exame, que plataforma nenhuma ensina direito.
A galera que passou costuma dizer que o importante é fazer muita questão mesmo, não só assistir aula. Escolhe uma base teórica (pode ser Khan, pode ser YouTube, tanto faz) e depois passa a maioria do tempo resolvendo ENEM antigo, analisando por que errrou.