No dejes que pase más tiempo, un ruido de fricción nunca es buena señal. Incluso si lo usas normalmente, puede ser un problema interno que se agrava. Tres años es bastante uso regular así que el desgaste es posible, pero hay varias cosas que verificar antes de llamar al servicio técnico.
Primero, limpia bien el bol y sobre todo fíjate si hay migas o residuos atrapados entre el bol y la junta, eso crea muchas veces ruidos raros. Verifica también que el bol está bien encajado correctamente y que nada está suelto adentro. A veces son cosas tontas pero pueden hacer mucho ruido. Hazlo funcionar sin nada adentro a diferentes velocidades para estar seguro de que no es solo con la comida.
Si sigue después de eso, bueno ahí sí hay que contactar a Thermomix. Parece un problema de motor o de rodamiento que se está gastando. Grabá un video del ruido si podés, eso ayuda al servicio técnico a entender rápido qué está pasando. Bajo garantía deberías tener una intervención gratis así que aprovechalo.