Os pontos são visíveis apenas em objetos monocromáticos (céu, parede) ou estragam praticamente cada foto? Isso importa, porque se forem notáveis só em condições específicas, é mais fácil se virar com a correção por software na pós-produção.
Se mesmo assim você decidir limpar - é, os kits especiais funcionam, mas o risco é realmente alto. A diferença é que você precisa ser o máximo de cuidadosa possível e se certificar antes de que a sujeira está mesmo na matriz e não no espelho ou no vidro protetor na frente dela (você verifica pelas fotos tiradas em modo live view, quando o espelho está levantado). Uma pera de ar é o passo mais seguro, com pincelinho já é mais arriscado. Pessoalmente, no seu caso eu pensaria seriamente em fazer uma limpeza profissional, porque até o mínimo toque na matriz feito errado e ela pode depois gerar artefatos nas fotos.