Direto ao veterinário com ela - isso é realmente a primeira coisa que você deveria fazer. A perda repentina de higiene é na grande maioria dos casos um problema médico, não de educação ou da caixa de areia. Infecções urinarias, problemas renais, diabetes e outras coisas não são nada raras em gatos e podem provocar exatamente esse comportamento. O veterinário consegue verificar isso com uma amostra de urina relativamente rápido.
Se o veterinário checar tudo do ponto de vista médico e não encontrar nada, aí você pode pensar se algo mais na casa mudou - novo vizinho, mudança de móveis, estresse, menos atenção. Alguns gatos também reagem com perda de higiene para essas coisas. Aí um segundo banheiro para gatos também poderia ajudar (a regra prática é: número de gatos mais um), ou você coloca o existente em outro lugar.
O mais importante mesmo é ir primeiro ao veterinário. Duas semanas já é bastante tempo e quanto mais rápido isso for esclarecido, melhor - tanto para a gata quanto para o seu apartamento.