Sim, é verdade que as lojas de eletrônicos abandonaram quase completamente os DVDs, mas não é totalmente impossível encontrá-los ainda. As lojas de quadrinhos e gibi no centro da cidade geralmente têm uma prateleira pequena dedicada a DVDs e blu-rays, principalmente filmes e séries que têm um seguidora de fãs. Tenta perguntar direto pros lojistas, talvez consigam encomendar o que você procura. Depois tem ainda as lojas de redes tipo a Feltrinelli ou similares que mantêm algo em estoque, mesmo que menos que antes, depende da cidade mas.
Honestamente o mercado de segunda mão é agora o mais rico: OLX é uma opção, mas considera também o eBay que às vezes tem vendedores confiáveis com boas seleções, e as lojas de usado espalhadas pelo centro também funcionam bem se você conhecer. Outra opção é procurar na internet especificamente "loja de DVD" na sua região, você vê o que aparece - de vez em quando na periferia ainda tem alguns negócios antigos que vendem filmes em DVD, especialmente aqueles que também fazem aluguel.
A coisa é que agora as pessoas vendem os DVDs que têm em casa, então encontrá-los em bom estado é possível também com preços não tão ruins. Se você tá em uma cidade de médio a grande porte deve se virar sem problemas, é só ter paciência. Pra títulos mais recentes ou raros talvez você tenha que esperar a oportunidade certa, mas os filmes clássicos dos anos 2000 que você falou normalmente saem bastante do mercado usado.