Em termos de durabilidade, o plástico vence sem dúvida - vai durar 20-30 anos tranquilamente, enquanto MDF se degrada mais rápido, especialmente na cozinha por causa da umidade e variações de temperatura. MDF empenará, inchará, a tinta descascará. Não pegue MDF para cozinha de jeito nenhum, lá simplesmente não vai durar muito.
Com a aparência é mais complicado. MDF parece mais nobre, imita madeira mais bonito, segura melhor a tinta, cola bem em verniz. Plástico parece plástico - mais barato e mais artificial visualmente, embora tenha modelos bem feitos. MDF também pinta melhor se você quiser depois refazer para um novo estilo.
A instalação é parecida, mas tem diferença. Plástico se prende mais fácil e rápido, fica mais fácil esconder fios dentro dele por meio de canaletas. MDF exige um pouco mais de cuidado - precisa cortar mais reto, os encaixes dão mais trabalho. Se é cozinha, considere plástico, apesar de ser menos bonito. Para sala de estar você pode arriscar MDF, lá tem menos umidade e vai durar mais.