Sí, definitivamente tienes que declarar el dinero que ganas del alquiler. No es una tontería, pero es algo que hay que corregir lo antes posible. La renta catastral y los cánones de alquiler son ingresos imponibles y deben declararse en tu declaración de la renta anual (el modelo 730 o Único, según tu situación). Si tienes un contrato registrado, la Agencia Tributaria ya lo sabe porque el contrato está depositado, así que ocultar el ingreso es realmente arriesgado.
Lo que puedes hacer ahora es presentar una declaración complementaria para los años en que no declaraste nada. Mejor hacerlo por tu cuenta que esperar a que te abran una inspección, porque si Hacienda lo descubre por su lado corres el riesgo de sanciones mucho más duras (empiezan en el 30% y pueden llegar al 90% del impuesto defraudado, más intereses). Si estás en regla con todo lo demás, pagar lo que debes ahora es mucho menos doloroso. Te conviene ir a un asesor fiscal o a una gestoría porque ellos saben exactamente cómo moverse y qué declarar - alquiler bruto, gastos deducibles, amortización del inmueble si eres propietaria de la casa, y así sucesivamente.
Date prisa con esto: la declaración complementaria se vuelve más complicada y cara si pasa demasiado tiempo. Dos años aún no son un desastre para resolver, pero no esperes otros meses.