He pasado por algo parecido con una filtración en casa que el casero tardaba una eternidad en arreglarse, así que entiendo la frustración. En la mayoría de comunidades autónomas españolas, tienes derecho a que el propietario realice las reparaciones necesarias para mantener la vivienda en condiciones habitables, y una gotera que daña la estructura definitivamente entra en eso. El problema es que retener el alquiler directamente es arriesgado legalmente - el casero puede denunciarte por impago aunque tengas razón, y luego habría que litigar para que un juez te diera la razón.
Lo más seguro es documentar todo: toma fotos del daño, guarda los mensajes en los que pides la reparación, y manda un burofax o correo certificado al casero dándole un plazo concreto (normalmente entre 10 y 15 días) para que arregle la gotera. Si no lo hace, ahí sí tienes opciones: puedes presentar una reclamación ante el mediador de vivienda de tu comunidad autónoma, acudir a los servicios municipales de inspección de viviendas para que lo sancionen, o directamente consultar con un abogado sobre si procede retener parte del alquiler con fundamento legal. En algunos casos también puedes hacer la reparación tú mismo y descontar el coste del alquiler, pero esto requiere que hayas agotado los intentos anteriores.
Lo importante es no pagar de menos de repente sin dejar constancia de tus intentos. Mantén un registro claro de tus comunicaciones y, si la situación no avanza en dos semanas, contacta con el ayuntamiento o busca asesoramiento legal en tu zona - muchos ofrecen consultas gratuitas. A nadie le interesa una vivienda con daños estructurales, así que un poco de presión oficial suele funcionar.