La situazione che descrivi è piuttosto rischiosa e non è ben coperta legalmente. Se il tuo contratto dice "in sede" ma stai lavorando da remoto, c'è uno scollamento tra quello che dice la carta e la realtà, e questo ti lascia vulnerabile. Se qualcosa va male dopo - un infortunio sul lavoro a casa tua, un licenziamento, un conflitto su orari o responsabilità - l'azienda può usare quel vecchio contratto a suo favore e tu rimani senza documentazione che rispecchia come stai realmente lavorando.
Quello che dovresti fare è chiedere per iscritto (email, messaggio, quello che sia ma che rimanga traccia) che aggiornino il tuo contratto per riflettere il lavoro remoto. Non è un capriccio tuo, è protezione reciproca. Specifica i termini: se è 100% remoto o ibrido, quale orario, dove conservi i documenti aziendali, come viene gestita la riservatezza a casa tua, tutto. Se l'azienda si rifiuta o non fa nulla, almeno hai quell'email dove hai chiesto di formalizzare le cose - quello ti protegge.
Alcuni dicono che ci sono già passati e è finita male, ed è perché hanno lasciato che passasse il tempo senza contratto. Non aspettare, non lasciare che "si abituino" al fatto che lavori da remoto senza aggiornare nulla. Più tempo passa così, più diventa complicato dopo argomentare quale fosse l'accordo reale. Muoviti adesso mentre tutto funziona bene, è molto più facile che negoziare quando c'è già un problema.