Basicamente o Snapseed interpreta os perfis de cor do iPhone de uma forma mais agressiva que o Lightroom, então o que você está vendo é real mas exagerado pelo app, não pelo iOS. Quando edito fotos com meu celular e passo de um app para outro noto exatamente a mesma coisa - no Snapseed tudo fica mais vibrante e saturado, enquanto que no Lightroom os tons ficam mais próximos do que vejo na tela.
O que funciona pra mim é fazer os ajustes no Snapseed mas depois diminuir um pouco a saturação geral antes de salvar, ou entro direto na ferramenta de "Selective" (a do dedo) e dessaturo só onde ficar muito forte, especialmente em peles que é aí onde mais incomoda o excesso de cor.