Você é obrigada a preparar o revestimento antes, é o básico.
Eu, da minha parte, primeiro faço um bom aspirado e passo um desengraxante nas juntas (o vinil adere mal à sujeira), depois aplico uma camada de nivelamento fluido tipo Mapei ou Ardex, isso preenche os vazios e nivela tudo.
A coisa que ninguém te fala: coloca um filme de polietileno fino entre o revestimento e o nivelamento se você está em uma área úmida, senão a umidade do azulejo vai fazer seu vinil clicável ondular em alguns meses.
Quando tiver seco (espera bem 24h no mínimo), aí você pode encaixar seu vinil sem preocupação.