O sulco na base do trilho da porta de correr é basicamente um túnel para ar, e é quase sempre aí que as correntes de ar vencem o vedante de borracha sozinho. O problema é que o trilho tem canais abertos nos dois lados mais a base exposta, então mesmo que você sele as bordas da porta, ar frio continua escoando por baixo pelo próprio sulco.
O conserto mais prático é preencher aquele canal inferior com algo flexível. Silicone funciona bem - passe um cordão ao longo de todo o sulco inferior por onde a porta desliza. Ele mantém uma certa flexibilidade para a porta continuar se movimentando suavemente, e se você precisar remover depois, sai sem muito trabalho. Outra opção é colocar uma corda de espuma dentro do sulco primeiro, depois aplicar silicone por cima, o que te dá melhor isolamento e usa menos silicone. Só toma cuidado para não usar algo tão espesso que impeça a porta de rolar livremente.
Também vale a pena dar uma olhada rápida naquela sugestão anterior de verificar se a porta está nivelada. Se a porta assentou de forma desigual com o tempo, uma lateral do vão do trilho pode estar mais larga que a outra, o que tornaria o vedamento mais difícil. Mas sendo honesto, até uma porta perfeitamente nivelada ainda precisa daquela base do canal abordada - o vedante de borracha simplesmente não consegue chegar lá.