Ando mexendo com compressão de vídeo para alguns projetos pessoais, e o HandBrake é genuinamente sua melhor opção se você quer algo gratuito e direto - ele permite que você use codificação H.265, que reduz bastante o tamanho dos arquivos, mas a contrapartida é um tempo de processamento maior. Antes de você se jogar em recodificar tudo, qual é sua largura de banda de upload? YouTube na verdade recompacta de novo mesmo, então às vezes o melhor custo-benefício é apenas deixar pequeno o suficiente para fazer upload de forma razoavelmente rápida em vez de ficar obcecado com taxa de bits. Você está fazendo upload dos arquivos originais ou já está editando-os antes?