O maior risco é engolir o enxaguante bucal regularmente, não seu uso externo. Se o usas como deveria - enxaguando e cuspindo, sem engolir - uma vez ao dia é totalmente seguro para um adulto. A fluorose (o efeito colateral do flúor em excesso) é principalmente um problema para crianças pequenas durante o desenvolvimento dos dentes, não para quem já tem a dentição formada.
O que realmente importa é o total de flúor que inges no dia. Se usas uma pasta de dentes com flúor, a água da torneira pode já conter, talvez uma escova elétrica com tratamento de flúor... aí sim, adicionar o enxaguante à noite fica redundante. Mas se a tua rotina é só pasta de dentes + enxaguante, estamos perfeitamente dentro da norma. Teu amigo provavelmente confunde isso com estudos sobre ingestões muito excessivas (tipo engolir litros de coisa com flúor). O Listerine que usas tem uma concentração padrão pensada justamente para uso diário, então zero problemas se não o engolires.