Aqui está o que notei: se os preços estão parados há um ano, isso não é necessariamente ruim para o comprador, mas também não é bom para quem conta com uma valorização. Três milhões em um apartamento é travar dinheiro por muito tempo, e ainda por cima com perspectivas incertas. E tem ainda os impostos, reformas, condomínio. Você quer multiplicar seu dinheiro, não simplesmente guardá-lo para dias difíceis.
Quanto a alternativas: imóvel comercial faz sentido se você está preparado para lidar com inquilinos. Mas dá para pensar mais largo - ações, títulos, talvez fundos de investimento. O risco é maior do que em apartamento, mas a liquidez é outra coisa. Ou uma combinação: parte em algo estável (títulos, CDBs), parte em crescimento (ações, talvez alguns imóveis nas periferias, que crescem mais rápido). O principal é não colocar tudo em um único ativo, especialmente se ele já está parado há um ano.
Minha opinião: antes de decidir, faça as contas e veja bem o que você realmente precisa. Se é sobre renda, um caminho; se é sobre segurança, é bem outro. Um apartamento em Novosibirsk sem valorização de preço só gera renda de aluguel, e isso, pra ser sincero, não é muito impressionante numa quantia desse tamanho.