Pneus de moto de origem costumam ser bem macios mesmo, especialmente em modelos esportivos como a YZF. Três meses é realmente pouco tempo, então o desgaste rápido pode vir de alguns fatores. Primeiro, verifica se não estás com pressão baixa demais - pneu murcho desgasta muito mais rápido e de forma irregular. Segundo, se andas muito em curvas fechadas ou fazes muita inclinação lateral, o pneu desgasta mais rápido porque a borracha está sempre a trabalhar naquele limite. A forma como freias também conta bastante - quem trava muito o pneu gasta mais depressa.
Quanto a mudar de marca, Michelin e Continental são marcas sólidas, mas não é só a marca que importa. O tipo de pneu é mais importante - se estás com pneus macios de origem (que vêm assim de fábrica porque a moto sai com mais grip), qualquer pneu mais resistente vai durar mais, mas pode dar menos aderência em curva. A questão é: precisas de um pneu que dure mais ou que tenha melhor performance? Existem pneus intermédios que equilibram bem as duas coisas, tipo os Michelin Pilot ou Continental ContiSportAttack.
Minha sugestão é experimentares mudar a forma como andas primeiro. Se é pressão, se é travagem, se é muito curva - isso faz diferença real. Depois, quando compres pneus, pede recomendações no fórum de motos para o teu modelo específico - há sempre pessoal que já testou várias combinações e sabe o que funciona melhor pra YZF.