Primeiro, tire fotos dessas manchas com data e hora porque se depois tiver que reclamar ao construtor, vai precisar de prova de quando começaram. Não importa se "é normal" - se há mofo visível em um apto novo, isso é um problema de construção ou design que eles têm que solucionar, ponto.
O que a maioria não diz é que os cantos interiores são os piores porque o ar não circula bem ali e a humidade se concentra. Enquanto espera para resolver isso com o construtor (e sim, definitivamente deveria reclamar porque não deveria acontecer em algo recém-feito), precisa ser agressiva com a ventilação. Abra as janelas todos os dias mesmo que seja só para deixar o ar correr, e se conseguir mantenha um desumidificador naquele quarto. Também limpe as manchas com uma mistura de água e vinagre branco ou com um fungicida básico - não use água sanitária pura porque pode danificar a tinta.
Agora, o ponto importante: se o edifício tem menos de alguns anos, o concreto e os materiais soltam um monte de humidade enquanto secam. Isso é real. Mas isso não significa que o construtor não seja responsável se há rachaduras, impermeabilização ruim ou problemas no selado das janelas. Quando fizer a reclamação, mencione que já ventila regularmente e mesmo assim acontece - isso demonstra que não é falta de cuidado da sua parte.