O que realmente importa aqui é que ele rejeita a conversa completamente, e isso é mais preocupante do que os likes em si. Três anos juntos significa que você já deveria conseguir falar sobre coisas que a deixam desconfortável sem que ele feche a porta. O fato de ele ficar irritado e dizer "é coisa do passado" é uma forma de não resolver nada, só de calar o assunto.
Tenta enfocar isso pela sua perspectiva emocional em vez de pelo que ele faz: "Olha, não me importa que você continue seguindo elas, mas me incomoda que não queira nem conversar sobre o porquê. Preciso entender o que significa pra você manter esse contato, porque eu também tenho direito de me sentir segura." Isso é diferente de acusá-lo de infidelidade emocional ou algo assim. O que você está pedindo é comunicação, não que ele apague as exs dele da internet.
Se depois de explicar assim ele continuar se recusando a conversar, aí sim você tem um problema de verdade. Não porque ele dá likes no Instagram, mas porque em um relacionamento de três anos deveria importar pra ele que você esteja à vontade. A galera que se recusa a explicar seus atos muitas vezes também não quer mudar nada, e isso sim é uma red flag.