Quando comecei a fazer exercício regularmente cometi o mesmo erro: pensava que mais dias = melhor forma, mas terminei com os mesmos incômodos que você descreve. O que acontece é que o corpo se adapta durante o descanso, não durante o treino, então três meses sem pausas reais é uma receita para o esgotamento.
O que te falta não é mais volume, mas recuperação estratégica. Você pode manter atividade leve nos dias de descanso (caminhar, alongar) para não sentir que para completamente, mas precisa de pelo menos um ou dois dias sem correr por semana, mais outros em que faça sessões curtas e tranquilas em vez de exigentes. Seu rendimento vai melhorar em uma ou duas semanas uma vez que descanse de verdade, porque agora mesmo está acumulando fadiga, não progredindo.