Você está usando abóbora fresca ou de lata? Porque aí pode fazer diferença. De qualquer forma, o que ninguém mencionou é que a textura também influencia em como percebemos o doce. Se você fizer muito cremosa e lisa, o sabor doce gruda mais no paladar. Tente deixar um pouco mais rústica, com alguns pedaços sem triturar completamente, ou até adicione algo com textura crocante no final: cubinhos de pão torrado, sementes de abóbora salteadas com sal, pão integral... isso quebra a monotonia e distrai o paladar do cansativo.
O segundo que falta na sua receita provavelmente seja algo mais substancioso. Se você leva apenas abóbora, caldo e cebola, está faltando corpo umami. Coloque um dente de alho bem torrado antes de adicionar o caldo, e considere usar um pouco de caldo de frango em vez de só legumes (ou uma mistura dos dois). Também funciona bem adicionar um pouco de gengibre fresco ralado enquanto cozinha - o ardor e a complexidade do sabor deslocam completamente a sensação de doce. Se não tiver gengibre à mão, até uma pitada de noz-moscada bem medida, sem exagerar, faz a diferença.