USB hoje francamente é relevante só se você tem arquivos de música antigos num pen drive e quer reproduzir - senão você paga sem ganhar nada de verdade. Com Bluetooth você consegue tudo do celular (navegação, música, telefone) e é simplesmente mais confortável, especialmente se você quer conectar vários dispositivos.
Um truque prático que muita gente ignora: quando for comprar, vê se o rádio suporta Android Auto ou Apple CarPlay - isso geralmente é mais importante do que ter USB. Você nem precisa usar o software do rádio em si, é só controlar o celular pela tela sensível ao toque, recebe atualizações e os aplicativos estão sempre atualizados. Já com um rádio só com USB você fica na mão rápido, se o fabricante parar de dar suporte.