Ситуация, которую ты описываешь, довольно рискованная и не очень хорошо защищена с юридической точки зрения. Если в твоём контракте написано "очное присутствие", а ты работаешь удалённо, то есть несоответствие между тем, что на бумаге, и реальностью, и это оставляет тебя в уязвимом положении. Если потом что-то пойдёт не так - производственная травма дома, увольнение, конфликт по поводу графика или обязанностей - компания может использовать старый контракт в своих целях, а ты останешься без документации, подтверждающей, как ты на самом деле работаешь.
Что ты должен сделать - попросить в письменном виде (письмо, сообщение, неважно, но чтобы остался след), чтобы они обновили контракт и отразили там удалённую работу. Это не твой каприз, это взаимная защита. Уточни условия: это 100% удалённо или гибридный формат, какой график, где ты хранишь документы компании, как соблюдается конфиденциальность у тебя дома, всё такое. Если компания откажется или просто не обратит внимание, у тебя по крайней мере будет то письмо, где ты просил оформить всё как положено - это тебя защитит.
Некоторые рассказывают, что уже прошли через это и закончилось плохо, и именно потому, что они дали времени пройти без документов. Не жди, не давай "привыкнуть" к тому, что ты работаешь удалённо без обновления ничего. Чем больше времени пройдёт так, тем сложнее потом будет доказывать, каков был реальный договор. Действуй сейчас, пока всё работает хорошо - намного легче, чем потом договариваться, когда уже есть проблема.