Quando cucino noto soprattutto quella differenza lì. A casa mia uso lo yogurt naturale per le marinature e i sughi, perché è semplicemente più stabile quando si riscalda. Lo yogurt normale con amido e addensanti dentro - quello mi si separa sempre quando lo riscaldo. È veramente fastidioso, quando stai preparando un sugo e all'improvviso sembra una zuppa di fiocchetti.
Dal punto di vista del gusto la differenza è evidente: lo yogurt naturale sa semplicemente di... beh, di yogurt insomma - acido, intenso. Lo yogurt normale è spesso più dolce e cremoso, perché appunto ci mettono dentro zucchero e amido. Se preferisci mangiarlo al naturale, lo yogurt naturale è probabilmente la scelta migliore, perché sai cosa c'è dentro. Per arricchire i piatti te lo consiglierei comunque, lo yogurt naturale, semplicemente perché la consistenza rimane più affidabile quando si riscalda.
Da un punto di vista legale le risposte precedenti hanno ragione - non esiste una definizione rigorosa, è più che altro una questione di marketing. Ma nella pratica, quando lo lavorori e per il gusto, la differenza la noti eccome.